http://intomysql.blogspot.kr/2010/12/innodb-redoundo.html
관련 내용이 가장 잘 정리 되어 있는곳입니다.
MySQL 5.6 부터 undo 분리가 가능하네요;;ㅎㅎ
위의 undo 내용에 관련된 reference 경로입니다.
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/innodb-multiple-tablespaces.html
Note
InnoDB always needs the shared tablespace because it puts its internal data dictionary and undo logs there. The .ibd files are not sufficient for InnoDB to operate.